Surveillance des eaux usées pour détecter la présence de SARS-COV-2
Surveillance
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Témoignages | Directives du CDC pour l'analyse des eaux usées | PCR numérique par gouttelettes pour la détection moléculaire du SARS-CoV-2 | Test développés par des experts |
À mesure que les taux d'infection de la COVID-19 continuent d'augmenter, le besoin de tests rapides, sensibles et fiables pour surveiller les cas et réduire la propagation de la COVID-19 va grandissant. Etant donné que les individus symptomatiques infectés par le SARS-CoV-2 symptomatiques et asymptomatiques excrètent de l'ARN viral dans le réseau des eaux usées, ces systèmes permettent de fournir une surveillance en temps réel de la propagation du virus du SARS-CoV-2 au niveau local, et de servir potentiellement de système d'alerte précoce pour détecter les contaminations de COVID-19 et prévenir la propagation du virus.
Témoignages
Découvrez comment des scientifiques du monde entier surveillent la propagation du SARS-CoV-2 au
niveau local à travers l'analyse des eaux usées.
Tami Sivy, Ph.D.
Saginaw Valley State University (SVSU), Michigan
La Dre Sivy explique comment la PCR numérique par gouttelettes a été utilisée pour surveiller les taux d'infection par le SARS-CoV-2 dans les villes à travers l'analyse des eaux usées.
David Szlag, Ph.D.
Oakland University
Le Dr Szlag décrit comment la PCR numérique par gouttelettes a été utilisée pour optimiser les tests COVID-19 et identifier les cas symptomatiques et asymptomatiques au niveau local à travers la surveillance des eaux usées.
Rachel Noble, Ph.D.
Université de Caroline du Nord à Chapel Hill
La Dre Noble, présente au travers de son expertise dans le traitement des échantillons dans des milieux difficiles et sa connaissance approfondie des agents pathogènes viraux dans les eaux usées, comment la PCR numérique par gouttelettes a aidé à développer des protocoles pour l’analyse des eaux usées.
Carol Wilusz, Ph.D.
Université d'État du Colorado (CSU)
La Dre Wilusz décrit comment son équipe a utilisé la technologie de PCR numérique par gouttelettes, en collaboration avec d'autres chercheurs, pour surveiller les niveaux de COVID-19 dans les stations de traitement des eaux usées du Colorado.
Dr Paul J. Parsons, Ph.D.
Université de Sheffield, Royaume-Uni
Le Dr Parsons explique comment la technologie de PCR numérique par gouttelettes a aidé à détecter le SARS-CoV-2 dans les eaux usées du Yorkshire afin d'identifier précocément les potentielles contaminations.
Dre Krista Wigginton, Ph.D.
Université du Michigan
La Dre Wellington explique comment son équipe a pu développer des méthodes fiables pour mesurer le SARS-CoV-2 dans les solides primaires à l'aide de la technologie ddPCR, et leur capacité à saisir la dynamique l'épidémie de COVID-19 dans le comté de Santa Clara, en Californie, au cours des premières semaines de la pandémie.
Guide des analyses de surveillance des eaux usées du CDC
Le CDC a publié des recommandations sur les méthodes d'analyse de surveillance des eaux usées et les flux de travail de laboratoire pour détecter le SARS-CoV-2 à travers les États-Unis.
Le procole RT-ddPCR en une étape est pertinent pour les eaux usées car la RT est réalisée sur des gouttelettes individuelles qui permet de réduire l'inhibition de la RT. En comparaison avec la RT de vrac, tout comme le protocole en deux étapes et la RT-qPCR.
En savoir plus sur les directives du CDC relatives aux eaux usées
Webinaire sur l'épidémiologie de COVID-19 dans les eaux usées
Methods and Insights for SARS-CoV-2 Community Surveillance
Aaron Bivins, Université Notre-Dame
Raul Gonzalez, Hampton Roads Sanitation District
Raul Gonzalez et Aaron Bivins échangent régulièrement sur leurs efforts continus dans la surveillance des eaux usées. Ces travaux sont destinés à dépister la propagation du SARS-CoV-2 en milieu urbain. La plate-forme ddPCR de Bio-Rad joue un rôle crucial dans ces recherches en offrant une détection ultra sensible du SARS-CoV-2 dans des échantillons complexes d’eaux usées.
PCR numérique par gouttelettes pour la détection moléculaire du SARS-CoV-2
Avec plus de 5 000 publications évaluées par des pairs et des milliers de systèmes installés dans le monde, la PCR numérique par gouttelettes est une technologie moléculaire éprouvée pour la détection et la quantification de cibles en très faibles quantités dans des milieux complexes.
Comparaison des fonctionnalités du système
| Temps de manipulation | |||
| Débit d'échantillons | |||
| nb de canaux de couleur | |||
| Thermocycleur |
Tests développés par des experts
Ces tests sont conçus pour des performances optimales de la ddPCR avec l'objectif de réduire l'incidence des faux positifs.
| Référence catalogue | Description | Réactions |
|---|---|---|
| dEXD28563542 | Dosage Triplex SARS-CoV-2 ddPCR | 200 rxns |
| dEXD41434415 | N1, N2, BRSV Triplex | 200 rxns |
| dEXD15704188 | N1, N2 Duplex | 200 rxns |
| dEXD79973961 | Bovine RSV | 200 rxns |
| dEXD54243734 | N1 | 200 rxns |
| dEXD28513507 | N2 | 200 rxns |
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La surveillance de la COVID-19 est nécessaire pour prendre des décisions sanitaires.Toutefois, un nombre important d'échantillons, le manque d'équipements et des échantillons complexes sont un obstacle dans cette lutte.
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