PrimePCR プライマー&アッセイ

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リアルタイムPCRおよびドロップレットデジタル™PCR用の、SYBR®GreenやEvaGreen®などのインターカレート色素を用いた未標識PCRプライマーセットおよび任意の蛍光色素を選択できる加水分解プローブを用いたPCRプライマー・プローブセットをご用意してます。

Get assays designed for Droplet Digital PCR

デジタルPCR用にプレデザインされたアッセイ
アプリケーションとターゲットを選ぶだけで簡単にアッセイが検索できます

Get assays designed for Droplet Digital PCR

qPCR用のカスタムプライマー&プローブアッセイ
希望のプライマー・プローブ配列を用いた合成をご用意してます

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PrimePCR検索ツール

アッセイおよびテンプレートの設定

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ケミストリー(複数選択可)

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PrimePCR Lookupツール

PrimePCR Lookupツールを使用すればお探しのアッセイやパネルをリストで検索できます PrimePCR Lookup Tool
PrimePCR™ Lookup Tool

Use the PrimePCR lookup tool to find assays and panels for your genes of interest.

Launch PrimePCR Lookup Tool



 

カスタムPCRプレートの作成

96ウェルもしくは384ウェルPCRプレートをデザインできます Create a Custom PCR Assay

カテゴリー別検索

パスウェイプレートの検索
疾患やパスウェイに関連したプレデザインPCRアレイプレートを検索できます
Find a Pathway Plate
ddPCRアッセイの検索
アプリケーションとターゲットを選ぶだけで簡単にアッセイが検索できます
Find a ddPCR Assay
Droplet Digital™ PCR Assays

Pricing for PrimePCR Droplet Digital PCR assays is based on assay type and the number of reactions.

Discount applies to bulk orders of the same catalog number and is taken off the list price.

Bulk discounts are shown below; download the pricing flyer for full details.

ddPCR Assays

5 or more assays

25% off

a

PrimePCRに関して

Design and Validation of Real-Time PCR Primers

Bio-Rad collaborated with Biogazelle, leaders in real-time PCR research, to design and experimentally validate PCR primers for gene expression assays across the human and mouse transcriptomes. All PCR primers were designed to meet stringent performance standards following the MIQE guidelines (minimum information for publication of quantitative real-time PCR experiments; Bustin et al. 2009).

Assay Performance Standards

Sensitivity Accurate detection of 20 copies
Specificity Amplicon sequence validated with next generation sequencing (NGS). Minimal primer dimer formation and genomic DNA cross reactivity.
Amplification Efficiency 90–110%
Linear Dynamic Range Minimum of six orders of magnitude. Detection of a synthetic template standard curve from 20 to 20 million copies.
R2 >0.99

These DNA primer pairs were designed by prioritizing the gene regions most commonly found in transcript variants. Strict design criteria were used to ensure optimal real-time PCR results for each target:

  • Target regions without SNPs
  • PCR primer pairs annealing across intron/exon junctions when possible
  • No secondary structure in primer annealing sites
  • Maximum number of transcript isoforms detected
  • PCR primers compatible with standard assay conditions

Every PCR primer pair was experimentally validated using Bio-Rad’s iScript™ advanced cDNA synthesis kit and SsoAdvanced™ SYBR® Green supermix. PrimePCR assay design and validation are fully described in the following publication.

PrimePCR Assays: Meeting the MIQE Guidelines by Full Wet-lab Validation

Pathway Curation

Thomson Reuters provided interactive pathway maps for 260 canonical pathways. Each pathway belongs to one or more general biological categories such as cancer. The pathway maps illustrate protein interactions and regulation to provide a comprehensive picture of signaling and disease processes. The selected pathways were used to design panels of real-time PCR primers tailored for the top-ranked genes for differential gene expression analysis. Each gene target within a pathway was assigned a score based on the frequency of differential expression and its research significance. The resulting scores were used to select the assays included in the corresponding real-time PCR pathway panel.

PrimePCR Pathway Analysis: Pathway Curation and Real-Time PCR Panel Design Strategy

Control and Reference Assays for Real-Time PCR

Control assays and synthetic DNA templates were designed to facilitate the assessment of the key experimental factors impacting your real-time PCR results.

DNA Contamination Control Assay
Use the PrimePCR DNA contamination control assay to determine if genomic DNA (gDNA) is present in a sample at a level that may affect PCR results. This assay may also be used to compare relative levels of gDNA contamination present in different samples to determine if PCR results may be affected.

Positive PCR Control Assay
Use the PrimePCR positive control assay to qualitatively assess the performance of a PCR reaction associated with a single sample. This assay may also be used to compare the relative performance of PCR reactions associated with different samples.

RNA Quality Assay
Use the PrimePCR RNA quality assay to determine if RNA integrity may adversely affect PCR results for a single sample. This assay may also be used to compare relative RNA integrity among different samples to determine how PCR results might be affected.

Reverse Transcription Control Assay
Use the PrimePCR reverse transcription control assay to qualitatively assess the performance of the reverse transcription reaction associated with a single sample. This assay may also be used to compare the relative performance of the reverse transcription reactions associated with different samples.

Reference Gene Assays
Reference genes are used in relative gene expression analysis to normalize for variation in the amount of input messenger RNA (mRNA) among samples. To ensure accurate quantitation, it is important to include one or more reference genes exhibiting constant expression levels under the experimental conditions. To streamline reference gene selection, we offer PCR primers for a set of commonly used reference genes that can be used individually, easily screened using our preplated 96-well and 384-well reference panels or added to custom-designed plates.

Show Reference Gene Assays
View Reference Gene Assay Panels



PrimePCRアッセイ選択ガイド

 

リアルタイムPCRアッセイ

ドロップレット デジタルPCRアッセイ

動物種 Human, mouse, rat, yeast, rhesus monkey,
arabidopsis, dog, chicken, zebrafish, cow, pig, rabbit
Human, mouse, rat
ケミストリー インターカレーション色素および加水分解プローブアッセイ
アプリケーション Gene expression
Preamplification
Copy number variation
Mutation detection
Gene expression
フォーマット シングルアッセイ
96ウェルおよび384ウェルでのプレデザインプレート*
96ウェルおよび384ウェルでのカスタムプレート*
シングルアッセイ

加水分解プローブアッセイのプレートでの提供はしておりません

リアルタイムPCR用インターカレーションダイアッセイおよび加水分解プローブアッセイ

弊社のリアルタイムPCR用プライマーは信頼性の高いアルゴリズムにより設計されています。また多くのPCRプライマーセットは事前にラボにて検証実験が行われ、そのパフォーマンスが確認されています。DNAプライマーセットのバリデーションに関するより詳細な情報は Bulletin 6262, PrimePCRアッセイバリデーションをご参照下さい。

PrimePCRの蛍光標識オリゴヌクレオチドプローブはマルチプレックスを可能にするよう設計されています。またこれらの5'ヌクレアーゼプローブは極めて高い特異性を持つよう設計されています。qPCR用プローブの蛍光標識としてFAM, HEX, TEX615, Cy5, or Cy5.5をご用意しております。

リアルタイムPCRアッセイは下記のフォーマットにてご利用頂けます:

  • プレデザインされたプライマーおよびプローブアッセイ — ヒトおよびマウスでの遺伝子発現解析アッセイ。
  • カスタムオリゴヌクレオチド — PCRプライマーまたはプローブアッセイをデザイン。
  • カスタム可能な96および384ウェルプレートカスタムプレートコンフィギュレータを使用してフレキシブルなPCRプレートを設計。
  • プレデザインされたパスウェイパネル — 様々な疾患やパスウェイ特異的なアッセイプレートを選択可能。
  • プレアンプアッセイ — 微量サンプルをバイアス無く1,000倍まで増幅。

コントロールとリファレンスを用いてアッセイの容易にできます。

  • 実験コントロール — 逆転写効率、RNAの品質確認、サンプルへのゲノムDNA混入およびPCR反応の性能を評価するために有用です。
  • リファレンスジーンアッセイ — サンプル間でのmRNA量の標準化は相対的な遺伝子発現解析の評価に大変有用です。
  • DNAテンプレート — リアルタイムPCRのポジティブコントロールとして対応する遺伝子テンプレートを提供しています。

すべてのアッセイおよびパネルのPCRデータは、 CFXリアルタイムPCR解析システムおよび付属ソフトウェアを用いてデータの収集と分析を行うことができます。

ドロップレットデジタルPCR用プローブに関して

ドロップレットデジタル (ddPCR™) テクノロジーは検量線を用いること無く高感度・高精度にターゲットDNAの絶対定量が可能であり、遺伝疾患、がん、感染症などの研究を飛躍的に進展させる革新的な技術です。QX200™ Droplet Digital PCRシステム用の加水分解ブローブアッセイは存在比率が低い変異遺伝子検出やコピー数多型の解析、微量な変化を伴う遺伝子発現解析に対し絶対数での結果を提供します。プローブの蛍光色素としてFAMおよびHEXをご用意しております。

より詳細な情報はBulletin 6512,をご参照下さい。

ドロップレットデジタルPCRアッセイは下記のフォーマットにてご利用頂けます:

  • プレデザインされた変異検出用プローブアッセイ - 対象サンプルとしてヒトのみをご用意しております。
  • プレデザインされたコピー数多型(CNV)用プローブアッセイ -対象サンプルとしてヒトのみをご用意しております。
  • カスタムオリゴヌクレオチド — dddPCR用加水分解プローブをカスタムで提供。

全てのPrimePCRアッセイ、プレート、およびコントロールは4℃で保存して下さい。

PrimePCR™ 解析ソフトウェアに関して

バイオ・ラッドが提供するGeneStudy v1.0.030.1023,をダウンロードすることにより、リアルタイムPCRで解析されたPrimePCRデータの遺伝子発現解析をより簡便に出来ます。解析オプションを利用して棒グラフ、クラスタグラム、散布図、ボルケーノプロット、およびヒートマップ分析が行えます。
Number Description ダウンロード
C11183L PrimePCRパーフェクトガイド クリックしてダウンロード
M11133L プレートアッセイ用簡易プロトコール クリックしてダウンロード
LIT10026370 Instruction Manual, PrimePCR Assays, Panels, and Controls, Rev E クリックしてダウンロード
10042030 PrimePCR™ PreAmp Assay Quick Guide, Rev A クリックしてダウンロード
10039761 PrimePCR™ Assays Quick Guide, Ver B クリックしてダウンロード
6763 Gene Expression Real-Time PCR Workflow Flier, Ver A クリックしてダウンロード
6290 PrimePCR Assays and Panels Brochure, Rev D クリックしてダウンロード
6595 PrimePCR™ Assays and Panels for Real-Time PCR Brochure, Rev A クリックしてダウンロード
6512 PrimePCR Assays for Droplet Digital PCR Brochure, Rev A クリックしてダウンロード
6629 High-Throughput Real-Time PCR Solutions Brochure, Ver B クリックしてダウンロード
10041702 PrimePCR™ ddPCR™ Gene Expression Assays (EvaGreen) Product Insert, Rev A クリックしてダウンロード
10048730 PrimePCR™ ddPCR™ Gene Expression Probe Assays Product Insert, Rev A クリックしてダウンロード
10033173 ddPCR™ Copy Number Variation Assays Product Insert, Ver C クリックしてダウンロード
10033487 ddPCR™ Mutation Detection Assays Product Insert, Ver C クリックしてダウンロード
10047489 ddPCR™ Mutation Detection Assays Product Insert, Ver B クリックしてダウンロード
6262 PrimePCR Assays: Meeting the MIQE Guidelines by Full Wet-Lab Validation, Rev B クリックしてダウンロード
6263 PrimePCR Pathway Analysis: Pathway Curation and Real-Time PCR Panel Design Strategy, Rev B クリックしてダウンロード
6679 Droplet Digital™ PCR: Multiplex Screening of KRAS Mutations in Cell-Free DNA Colorectal Cancer Samples Application Note, Rev A クリックしてダウンロード
6634 A Fast Semi-Automated Quantitative PCR Method for Monitoring Differential Gene Expression for Drug Target Discovery, Ver B クリックしてダウンロード
6734 PrimePCR™ Publications List, Rev A クリックしてダウンロード
6777 Protocol for Single Cell Gene Expression Profiling by Multiplex RT-qPCR, Ver A クリックしてダウンロード
6816 Protocol for Multiplex RT-qPCR Analysis Using PrimePCR™ Assays, Ver A クリックしてダウンロード
10000065278 ddPCR™ NHEJ Genome Edit Detection Assays, Ver A クリックしてダウンロード
10000065279 ddPCR™ HDR Genome Edit Detection Assays, Predesigned, Ver A クリックしてダウンロード
10000065281 ddPCR™ HDR Genome Edit Detection Assays, Ver A クリックしてダウンロード